Die Basilika stellt ein Schlüsseldenkmal des frühchristlichen Kirchenbaus dar: Von den konstantinischen Kirchenstiftungen ist nur sie vollständig frei von späteren baulichen Überformungen geblieben. Damit bietet der Bau von Ostia die Möglichkeit, den ursprünglichen Bautypus in seiner Gesamtheit für typologische, architekturgeschichtliche und liturgiegeschichtliche Fragestellungen zu analysieren. Darüber hinaus handelt es sich um das erste bekannte Beispiel einer "Standard"-Basilika, die weder als Ex-voto-Stiftung noch als architektonischer Schrein um ein verehrtes Grab oder als Cömeterialkirche errichtet wurde.
Seit dem Sommer 2023 führt ein Team der Abteilung Christliche Archäologie der Universität Bonn in Kooperation mit der Klassischen Archäologie der Universität zu Köln sowie dem Deutschen Archäologischen Institut, Abteilung Rom, unterstützt von Studierenden der Universitäten La Sapienza, Roma Tre und des Pontificio Istituto di Archeologia Cristiana, die Ausgrabungen im Bereich der Bischofskirche durch.
Die erste Kampagne konzentrierte sich auf den Ostabschluss der Kirche mit Apsis und Presbyterium. Dabei konnten wichtige Erkenntnisse zur Bautypologie, Chronologie und liturgischen Ausstattung gewonnen werden, darunter die Identifizierung einer bislang unbekannten Bauphase mit der Errichtung einer solea im Mittelschiff der Kirche sowie Hinweise auf eine ungewöhnliche Apsisform der konstantinischen Basilika. In der zweiten Kampagne im Sommer 2024 lag der westliche Bereich der Basilika mit dem Übergang zum Atrium im Fokus. Neben einem großflächig erhaltenen Bodenmosaik aus konstantinischer Zeit kamen verstürzte Arkadenbögen sowie ein ionisches Kapitell zutage, die einen weiteren Einblick in die Gestaltung des sakralen Innenraums ermöglichen. Die dritte Grabungskampagne im Sommer 2025 widmete sich dem Bereich im Süden der Basilika und des Atriums bis hin zur Stadtmauer. Im Mittelpunkt standen das Baptisterium sowie das mutmaßlichen Episkopium. Dessen Existenz konnte durch den Nachweis einer großen Aula mit Bodenmosaik und marmorner Wandverkleidung bestätigt werden. Die Untersuchung des Übergangs zwischen Atrium und Straße sowie der östliche Bereich des Episkopiums ist für die kommenden Jahre geplant.